Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms