Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms