Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms