Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms