Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP170Q5SW79 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms