Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP188Q5SRE5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms