Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms