Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms