Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms