Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NBPF1Q3BBV0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms