Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms