Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms