Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP6Q16828 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP6Q16828 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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