Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms