Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
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