Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBBP7Q16576 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms