Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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