Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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