Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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