Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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