Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCM1Q15154 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms