Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD3Q15054 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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