Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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