Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNIP1Q15025 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms