Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP1BQ14684 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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