Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA3AQ14563 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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