Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN1Q14457 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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