Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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