Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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UBE4AQ14139 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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UBE4AQ14139 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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UBE4AQ14139 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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UBE4AQ14139 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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UBE4AQ14139 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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UBE4AQ14139 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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UBE4AQ14139 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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