Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL4Q14135 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL4Q14135 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms