Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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