Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCINQ13939 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCINQ13939 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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