Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
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SHROOM2Q13796 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
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SHROOM2Q13796 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHROOM2Q13796 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
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