Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms