Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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