Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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