Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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