Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms