Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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