Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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