Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIAQ12857 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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