Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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RASGEF1BQ0VAM2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RASGEF1BQ0VAM2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RASGEF1BQ0VAM2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RASGEF1BQ0VAM2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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