Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLEQ07864 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms