Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms