Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms