Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms