Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms