Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms