Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NHLH2Q02577 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms