Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms